26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0727 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0727    100 
 
 
162 bp  321  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  99.24 
 
 
1341 bp  254  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  98.48 
 
 
1323 bp  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  98.48 
 
 
1323 bp  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  98.48 
 
 
1323 bp  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  97.73 
 
 
1323 bp  238  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  96.97 
 
 
1323 bp  230  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  96.21 
 
 
1323 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  96.21 
 
 
1323 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3484    96.21 
 
 
1993 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  96.21 
 
 
1323 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  96.21 
 
 
1323 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  96.21 
 
 
1323 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  95.45 
 
 
1341 bp  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  95.45 
 
 
1323 bp  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0694    94.7 
 
 
1341 bp  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00319575  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  94.7 
 
 
1323 bp  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  90.15 
 
 
1323 bp  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  90.15 
 
 
1323 bp  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  90.15 
 
 
1323 bp  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  90.15 
 
 
1323 bp  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  100 
 
 
1419 bp  61.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  100 
 
 
285 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  100 
 
 
285 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  100 
 
 
285 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3312    100 
 
 
234 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>