21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4623 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4434  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.341224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4623  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4531  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  98.78 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4382  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  98.37 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4438  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  94.72 
 
 		 245 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4506  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  94.31 
 
 		 245 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_12  hypothetical protein, putative conjugative transfer protein TrbC  45.21 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0032  hypothetical protein  31.1 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1529  hypothetical protein  36.67 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2659  hypothetical protein  37.07 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2326  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0830351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4297  hypothetical protein  31.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.654961 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0023  conjugal transfer pilus assembly protein TrbC  30 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0024  hypothetical protein  30.07 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.43929  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3999  hypothetical protein  28.76 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4232  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  28.57 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  28.17 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4173  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0999993 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0350  sex pilus assembly and mating pair formation protein  29.6 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.448166 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6166  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00855701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>