19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6166 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6166  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00855701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0350  sex pilus assembly and mating pair formation protein  52.28 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.448166 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4173  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0999993 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.14 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2659  hypothetical protein  34.33 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3999  hypothetical protein  40.52 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6807  hypothetical protein  30.83 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2326  hypothetical protein  29.32 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0830351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1529  hypothetical protein  32.17 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0032  hypothetical protein  31.51 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451875  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4232  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  31.97 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6231  hypothetical protein  33.91 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0023  conjugal transfer pilus assembly protein TrbC  29.2 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4506  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4438  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4531  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4623  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4382  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4434  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.341224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>