21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4232 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4232  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  100 
 
 		 250 aa  487  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  39.74 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3999  hypothetical protein  37.58 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.654961 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0032  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451875  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0023  conjugal transfer pilus assembly protein TrbC  31.31 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0350  sex pilus assembly and mating pair formation protein  34.21 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.448166 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6166  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  31.97 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00855701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2659  hypothetical protein  27.89 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4173  hypothetical protein  31.06 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0999993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2326  hypothetical protein  29.47 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0830351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_12  hypothetical protein, putative conjugative transfer protein TrbC  24.81 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1529  hypothetical protein  30.09 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6807  hypothetical protein  34.68 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4434  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  28.57 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.341224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4506  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.73 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4623  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  28.57 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4438  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.73 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4531  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.73 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4382  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.73 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0024  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.43929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>