24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2659 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2659  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2326  hypothetical protein  87.3 
 
 		 252 aa  441  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0830351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1529  hypothetical protein  63.53 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4173  hypothetical protein  31.02 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0999993 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6807  hypothetical protein  36.72 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0350  sex pilus assembly and mating pair formation protein  35.63 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.448166 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  31.87 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4506  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.07 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6166  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  34.33 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00855701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4434  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.07 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.341224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4623  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.07 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4438  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.07 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4531  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.07 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4382  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  37.07 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0032  hypothetical protein  31.36 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451875  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3999  hypothetical protein  31.69 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4232  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  27.89 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_12  hypothetical protein, putative conjugative transfer protein TrbC  30.77 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0310  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  23.95 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0248  hypothetical protein  25.32 
 
 		 328 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0968  hypothetical protein  24.67 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00159039  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4297  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.654961 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6231  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0023  conjugal transfer pilus assembly protein TrbC  28.57 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>