41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3359 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3359  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02760  predicted DNA-binding transcriptional regulator  97.52 
 
 		 169 aa  304  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.310913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02723  hypothetical protein  97.52 
 
 		 169 aa  304  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.260135  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0764  mannitol repressor, MtlR  97.52 
 
 		 169 aa  304  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3264  putative DNA-binding transcriptional regulator  96.89 
 
 		 169 aa  300  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.577406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0781  putative DNA-binding transcriptional regulator  96.89 
 
 		 169 aa  300  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.365395  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3087  putative DNA-binding transcriptional regulator  96.89 
 
 		 169 aa  300  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3071  putative DNA-binding transcriptional regulator  96.27 
 
 		 169 aa  299  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4231  putative DNA-binding transcriptional regulator  95.03 
 
 		 169 aa  291  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3317  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.71 
 
 		 169 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3250  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.71 
 
 		 173 aa  288  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.985054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001415  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0054  mannitol repressor protein  27.78 
 
 		 201 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.667154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4163  mannitol repressor protein  27.16 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4445  mannitol repressor protein  28.83 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3778  mannitol repressor protein  26.09 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0028  mannitol repressor protein  26.09 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4126  mannitol repressor protein  26.09 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2815  mannitol repressor protein  28.4 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3887  mannitol repressor protein  27.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3903  mannitol repressor protein  27.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4010  mannitol repressor protein  27.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.272452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3965  mannitol repressor protein  27.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.723807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4072  mannitol repressor protein  27.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03407  hypothetical protein  25.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4971  mannitol repressor protein  35.29 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0105  mannitol repressor, MtlR  25.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03456  DNA-binding repressor  25.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3808  mannitol repressor protein  25.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.498661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4018  mannitol repressor protein  25.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3934  mannitol repressor protein  25.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0111  mannitol repressor protein  35.29 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4100  mannitol repressor protein  35.29 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0134  mannitol repressor protein  31.3 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0194  mannitol repressor protein  26.67 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0090  mannitol repressor protein  26.11 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0074  mannitol repressor protein  32.35 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0984  mannitol repressor protein  26.8 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00832  mannitol repressor protein  26.22 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1250  mannitol repressor protein  22.15 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001634  mannitol operon repressor  25.61 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>