41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001634 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001634  mannitol operon repressor  100 
 
 		 176 aa  350  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00832  mannitol repressor protein  97.73 
 
 		 176 aa  323  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0194  mannitol repressor protein  72.16 
 
 		 193 aa  273  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2815  mannitol repressor protein  69.32 
 
 		 176 aa  261  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4072  mannitol repressor protein  40.59 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3903  mannitol repressor protein  40.59 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3887  mannitol repressor protein  40.59 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0134  mannitol repressor protein  41.18 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4010  mannitol repressor protein  40.59 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.272452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3965  mannitol repressor protein  40.59 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.723807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1250  mannitol repressor protein  42.44 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03456  DNA-binding repressor  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4018  mannitol repressor protein  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3934  mannitol repressor protein  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03407  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3808  mannitol repressor protein  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.498661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0105  mannitol repressor, MtlR  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0074  mannitol repressor protein  38.01 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0111  mannitol repressor protein  40 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4100  mannitol repressor protein  40 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4971  mannitol repressor protein  40 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0984  mannitol repressor protein  41.57 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3778  mannitol repressor protein  39.39 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0028  mannitol repressor protein  39.39 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4126  mannitol repressor protein  39.39 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0054  mannitol repressor protein  38.24 
 
 		 201 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.667154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0090  mannitol repressor protein  40.72 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4163  mannitol repressor protein  37.06 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4445  mannitol repressor protein  37.36 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3359  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.61 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001415  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3250  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.12 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.985054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3317  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.12 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02723  hypothetical protein  25.4 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.260135  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0764  mannitol repressor, MtlR  25.4 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02760  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.4 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.310913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3071  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0781  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.365395  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3264  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.577406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3087  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4231  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.1 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>