63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0858 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  99.44 
 
 		 819 bp  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2982    99.72 
 
 		 480 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0312    99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  99.44 
 
 		 735 bp  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  98.61 
 
 		 819 bp  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  99.44 
 
 		 885 bp  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  98.89 
 
 		 819 bp  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  99.17 
 
 		 819 bp  690    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  99.44 
 
 		 1140 bp  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0858    100 
 
 		 495 bp  981    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  99.44 
 
 		 819 bp  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  99.72 
 
 		 819 bp  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 		 819 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  96.35 
 
 		 819 bp  603  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0192    97.01 
 
 		 774 bp  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0244  IS3 family element, transposase orfB  98.99 
 
 		 222 bp  379  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1566  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 144 bp  270  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4358    100 
 
 		 1410 bp  270  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2132  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 204 bp  270  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.609003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4645  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 150 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3273  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 156 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4300  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 153 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  100 
 
 		 948 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1951  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 147 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0900  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 150 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0389  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 147 bp  268  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  99.26 
 
 		 1176 bp  262  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1659    98.52 
 
 		 1870 bp  252  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.135951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3994  nitrite extrusion protein 2  98.52 
 
 		 165 bp  252  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1322    100 
 
 		 630 bp  161  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0951273  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0084    93.75 
 
 		 153 bp  95.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660347  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0239  RelB antitoxin family  100 
 
 		 405 bp  75.8  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0107    100 
 
 		 147 bp  61.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0048764  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2945  putative HTH-type transcriptional regulator YfiE  100 
 
 		 327 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4759  hypothetical protein  100 
 
 		 168 bp  56  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3627    100 
 
 		 693 bp  56  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2430    100 
 
 		 486 bp  56  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.598905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0919  outer membrane porin protein LC  100 
 
 		 528 bp  56  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00124369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2710  hypothetical protein  100 
 
 		 765 bp  56  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.357909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3247  putative acyltransferase  100 
 
 		 444 bp  56  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4285  hypothetical protein  88.46 
 
 		 147 bp  56  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  96.43 
 
 		 2769 bp  48.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>