65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0731 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0731  ecotin  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2358  ecotin  99.38 
 
 
162 aa  332  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2508  ecotin  99.38 
 
 
162 aa  332  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1449  proteinase inhibitor I11 ecotin  98.77 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.524876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3347  ecotin  98.77 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201992  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1441  ecotin  98.77 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2347  ecotin  98.77 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02095  hypothetical protein  98.77 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02136  ecotin precursor  98.77 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2398  ecotin  79.27 
 
 
168 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2502  ecotin  78.66 
 
 
168 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2446  ecotin  78.66 
 
 
168 aa  257  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.271723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2605  ecotin  78.66 
 
 
168 aa  257  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2488  ecotin  78.66 
 
 
168 aa  257  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.943775  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2787  ecotin  77.85 
 
 
167 aa  254  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2772  ecotin  64.63 
 
 
169 aa  208  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1316  ecotin  64.63 
 
 
169 aa  208  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2851  ecotin  64.63 
 
 
169 aa  208  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1637  ecotin  68.84 
 
 
170 aa  206  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2652  ecotin  62.12 
 
 
159 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3072  ecotin  62.12 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0760519  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2794  ecotin  62.12 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0520293  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28450  ecotin  53.46 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2719  ecotin  59.26 
 
 
159 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.141644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2620  ecotin  54.25 
 
 
161 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2482  ecotin  56.39 
 
 
215 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3164  proteinase inhibitor I11, ecotin  49.24 
 
 
158 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.403723  normal  0.0818337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5713  ecotin  47.73 
 
 
166 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1775  ecotin  47.73 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2392  ecotin  47.73 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2387  ecotin  47.73 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0903  ecotin  47.41 
 
 
165 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.092793  normal  0.0217852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2432  ecotin  43.64 
 
 
166 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2296  ecotin  46.21 
 
 
166 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1549  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1123  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1117  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1272  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3044  ecotin  43.97 
 
 
173 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3020  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0977  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.473184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1296  proteinase inhibitor I11, ecotin  45.6 
 
 
161 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000482651  hitchhiker  0.00123661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0907  ecotin  43.97 
 
 
179 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2329  ecotin  39.29 
 
 
193 aa  124  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2431  proteinase inhibitor I11 ecotin  37.97 
 
 
167 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2312  ecotin  41.22 
 
 
183 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2074  ecotin  37.11 
 
 
189 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.834078  normal  0.0269817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2535  ecotin  35.22 
 
 
190 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2640  proteinase inhibitor I11 ecotin  41.54 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1754  ecotin  39.04 
 
 
185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0245712  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06891  hypothetical protein  45.24 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2375  ecotin  41.98 
 
 
183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2800  ecotin  37.76 
 
 
195 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000004306  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2258  ecotin  41.22 
 
 
183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00144705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2099  ecotin  41.22 
 
 
183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2044  ecotin  33.79 
 
 
185 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.899442  normal  0.233664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2000  ecotin  37.16 
 
 
183 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1947  ecotin  37.16 
 
 
183 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22639  normal  0.198889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2087  ecotin  41.22 
 
 
183 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00034403  normal  0.0104938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2023  ecotin  34.21 
 
 
183 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.71544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2029  ecotin  36.49 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1926  ecotin  39.06 
 
 
188 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0963  ecotin  38.21 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1222  ecotin  34.59 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000104817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1880  hypothetical protein  26.17 
 
 
230 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>