65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2794 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2794  ecotin  100 
 
 		 159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0520293  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2719  ecotin  90.57 
 
 		 159 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.141644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2652  ecotin  95.6 
 
 		 159 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3072  ecotin  94.97 
 
 		 159 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0760519  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28450  ecotin  69.54 
 
 		 156 aa  226  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2620  ecotin  68.92 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2482  ecotin  72.59 
 
 		 215 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0731  ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  184  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1449  proteinase inhibitor I11 ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.524876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1441  ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2347  ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02095  hypothetical protein  57.32 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02136  ecotin precursor  57.32 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2358  ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2508  ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3347  ecotin  57.32 
 
 		 162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3164  proteinase inhibitor I11, ecotin  59.18 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.403723  normal  0.0818337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2787  ecotin  51.81 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2398  ecotin  59.56 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2502  ecotin  58.82 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2446  ecotin  58.82 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.271723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2488  ecotin  58.82 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.943775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2605  ecotin  58.82 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1637  ecotin  59.4 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2851  ecotin  58.39 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1316  ecotin  58.39 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2772  ecotin  58.39 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1296  proteinase inhibitor I11, ecotin  49.68 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000482651  hitchhiker  0.00123661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0907  ecotin  52.82 
 
 		 179 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0977  ecotin  51.41 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.473184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1272  ecotin  51.41 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3020  ecotin  51.41 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1549  ecotin  51.41 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1123  ecotin  51.41 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1117  ecotin  51.41 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3044  ecotin  51.41 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1775  ecotin  54.96 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2387  ecotin  54.96 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2392  ecotin  54.96 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5713  ecotin  56.35 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2296  ecotin  55.56 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2432  ecotin  55.56 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0903  ecotin  53.17 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.092793  normal  0.0217852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2431  proteinase inhibitor I11 ecotin  43.04 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2329  ecotin  45.16 
 
 		 193 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2312  ecotin  40.67 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1754  ecotin  46.22 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0245712  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2023  ecotin  36.18 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.71544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2044  ecotin  41.13 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.899442  normal  0.233664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2535  ecotin  40.3 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2258  ecotin  41.13 
 
 		 183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00144705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2375  ecotin  41.94 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2074  ecotin  34.81 
 
 		 189 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.834078  normal  0.0269817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2099  ecotin  41.13 
 
 		 183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06891  hypothetical protein  48.33 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2087  ecotin  40.32 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00034403  normal  0.0104938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1947  ecotin  37.76 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22639  normal  0.198889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2000  ecotin  37.76 
 
 		 183 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2029  ecotin  37.76 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2640  proteinase inhibitor I11 ecotin  44.09 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2800  ecotin  43.22 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000004306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1926  ecotin  42.74 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0963  ecotin  34.69 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1222  ecotin  32.23 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000104817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1880  hypothetical protein  26.47 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>