64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1926 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1926  ecotin  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2074  ecotin  47.8 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.834078  normal  0.0269817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2023  ecotin  51.43 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.71544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2800  ecotin  47.75 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000004306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2312  ecotin  50 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2375  ecotin  50.29 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2258  ecotin  49.71 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00144705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2099  ecotin  49.71 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2329  ecotin  47.73 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2087  ecotin  48.55 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00034403  normal  0.0104938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2535  ecotin  45.9 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2000  ecotin  51.53 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2029  ecotin  50.92 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1947  ecotin  50.92 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22639  normal  0.198889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2044  ecotin  50.31 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.899442  normal  0.233664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1754  ecotin  45.98 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0245712  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2719  ecotin  44.44 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.141644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2794  ecotin  42.74 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0520293  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1296  proteinase inhibitor I11, ecotin  37.1 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000482651  hitchhiker  0.00123661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3072  ecotin  39.52 
 
 		 159 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0760519  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2652  ecotin  39.52 
 
 		 159 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2787  ecotin  39.1 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3164  proteinase inhibitor I11, ecotin  37.8 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.403723  normal  0.0818337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2432  ecotin  37.4 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2296  ecotin  37.4 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0903  ecotin  37.69 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.092793  normal  0.0217852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28450  ecotin  38.4 
 
 		 156 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1637  ecotin  39.01 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5713  ecotin  36.84 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2482  ecotin  37.1 
 
 		 215 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2392  ecotin  37.21 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2851  ecotin  35 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1316  ecotin  35 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2772  ecotin  35 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1775  ecotin  37.21 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2387  ecotin  37.21 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1441  ecotin  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2358  ecotin  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0731  ecotin  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1449  proteinase inhibitor I11 ecotin  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.524876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02095  hypothetical protein  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2347  ecotin  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02136  ecotin precursor  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2508  ecotin  39.06 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1880  hypothetical protein  33.83 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2398  ecotin  38.58 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2620  ecotin  32.05 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2446  ecotin  38.58 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.271723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2488  ecotin  38.58 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.943775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2605  ecotin  38.58 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3347  ecotin  38.28 
 
 		 162 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2502  ecotin  37.8 
 
 		 168 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2431  proteinase inhibitor I11 ecotin  36.29 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1123  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1117  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3044  ecotin  36.22 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0977  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.473184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1549  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1272  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3020  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0907  ecotin  36.29 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06891  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2640  proteinase inhibitor I11 ecotin  33.33 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0963  ecotin  26.27 
 
 		 151 aa  62  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>