64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2312 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2312  ecotin  100 
 
 		 183 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2258  ecotin  80.33 
 
 		 183 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00144705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2087  ecotin  79.78 
 
 		 183 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00034403  normal  0.0104938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2375  ecotin  79.78 
 
 		 183 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2099  ecotin  79.78 
 
 		 183 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2023  ecotin  75.41 
 
 		 183 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.71544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2000  ecotin  80.33 
 
 		 183 aa  297  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2029  ecotin  78.69 
 
 		 183 aa  293  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1947  ecotin  79.23 
 
 		 183 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22639  normal  0.198889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2329  ecotin  62.64 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2535  ecotin  61.71 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2074  ecotin  60.59 
 
 		 189 aa  234  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.834078  normal  0.0269817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2800  ecotin  59.66 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000004306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1754  ecotin  59.17 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0245712  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2044  ecotin  60.98 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.899442  normal  0.233664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1926  ecotin  50 
 
 		 188 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0903  ecotin  44.96 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.092793  normal  0.0217852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2296  ecotin  43.51 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2432  ecotin  43.51 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1637  ecotin  43.85 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2787  ecotin  40.54 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3164  proteinase inhibitor I11, ecotin  41.33 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.403723  normal  0.0818337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2508  ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2358  ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0731  ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2446  ecotin  42.03 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.271723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5713  ecotin  43.51 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2488  ecotin  42.03 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.943775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2605  ecotin  42.03 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3347  ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1441  ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2347  ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1449  proteinase inhibitor I11 ecotin  41.22 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.524876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02095  hypothetical protein  41.22 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02136  ecotin precursor  41.22 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2398  ecotin  41.3 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2719  ecotin  42.86 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.141644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2794  ecotin  45.16 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0520293  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2652  ecotin  44.09 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3072  ecotin  44.09 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0760519  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2502  ecotin  40.58 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2387  ecotin  43.41 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2392  ecotin  43.41 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1775  ecotin  43.41 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1316  ecotin  39.07 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2772  ecotin  39.07 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2851  ecotin  39.07 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28450  ecotin  42.86 
 
 		 156 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2482  ecotin  42.86 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1117  ecotin  43.09 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1123  ecotin  43.09 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1549  ecotin  43.09 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3020  ecotin  43.09 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0977  ecotin  43.09 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.473184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1272  ecotin  43.09 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3044  ecotin  43.09 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1296  proteinase inhibitor I11, ecotin  40.32 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000482651  hitchhiker  0.00123661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0907  ecotin  43.44 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2620  ecotin  41.09 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2431  proteinase inhibitor I11 ecotin  41.46 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06891  hypothetical protein  40.3 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0963  ecotin  33.33 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1880  hypothetical protein  32.12 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2640  proteinase inhibitor I11 ecotin  34.38 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>