59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1880 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1926  ecotin  33.83 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2329  ecotin  27.59 
 
 		 193 aa  88.6  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2087  ecotin  29.44 
 
 		 183 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00034403  normal  0.0104938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2800  ecotin  34.31 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000004306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2258  ecotin  29.8 
 
 		 183 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00144705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2099  ecotin  29.8 
 
 		 183 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2375  ecotin  29.8 
 
 		 183 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2312  ecotin  32.12 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2044  ecotin  32.85 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.899442  normal  0.233664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1754  ecotin  29.84 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0245712  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2023  ecotin  29.93 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.71544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2000  ecotin  29.41 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1947  ecotin  29.41 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22639  normal  0.198889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2029  ecotin  29.41 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2535  ecotin  26 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2074  ecotin  26.24 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.834078  normal  0.0269817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2482  ecotin  29.08 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28450  ecotin  28.37 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2652  ecotin  27.94 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3072  ecotin  27.94 
 
 		 159 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0760519  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2794  ecotin  26.47 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0520293  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2787  ecotin  27.61 
 
 		 167 aa  51.6  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3164  proteinase inhibitor I11, ecotin  29.01 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.403723  normal  0.0818337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2719  ecotin  27.21 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.141644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2502  ecotin  28.67 
 
 		 168 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3347  ecotin  26.85 
 
 		 162 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2398  ecotin  28.67 
 
 		 168 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2605  ecotin  27.52 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2488  ecotin  27.52 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.943775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2296  ecotin  24.82 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2446  ecotin  27.52 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.271723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2432  ecotin  24.82 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2358  ecotin  26.17 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2508  ecotin  26.17 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0731  ecotin  26.17 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1441  ecotin  26.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02095  hypothetical protein  26.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02136  ecotin precursor  26.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1449  proteinase inhibitor I11 ecotin  26.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.524876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2347  ecotin  26.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5713  ecotin  24.82 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2620  ecotin  23.7 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0977  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.473184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3020  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1272  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0907  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3044  ecotin  27.59 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1117  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1123  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1549  ecotin  27.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0903  ecotin  24.44 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.092793  normal  0.0217852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1296  proteinase inhibitor I11, ecotin  23.13 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000482651  hitchhiker  0.00123661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2392  ecotin  24.24 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2387  ecotin  24.24 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1775  ecotin  24.24 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2851  ecotin  24.66 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2772  ecotin  24.66 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1316  ecotin  24.66 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>