48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1222 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1222  ecotin  100 
 
 
142 aa  289  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000104817  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0462  hypothetical protein  38.16 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.599543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3164  proteinase inhibitor I11, ecotin  35.34 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.403723  normal  0.0818337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1637  ecotin  34.86 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28450  ecotin  36.45 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0731  ecotin  34.59 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2482  ecotin  36.45 
 
 
215 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2652  ecotin  33.33 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3072  ecotin  33.33 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0760519  normal  0.784127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1449  proteinase inhibitor I11 ecotin  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.524876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02095  hypothetical protein  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2358  ecotin  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1441  ecotin  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2508  ecotin  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2347  ecotin  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02136  ecotin precursor  33.59 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2502  ecotin  32.54 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2794  ecotin  32.23 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0520293  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2398  ecotin  32.54 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3347  ecotin  32.81 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201992  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2772  ecotin  30.6 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2851  ecotin  30.6 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1316  ecotin  30.6 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2605  ecotin  31.75 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2488  ecotin  31.75 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.943775  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0963  ecotin  30.07 
 
 
151 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2446  ecotin  31.75 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.271723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2620  ecotin  31.67 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2787  ecotin  31.4 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2431  proteinase inhibitor I11 ecotin  27.97 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2719  ecotin  31.4 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.141644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1272  ecotin  27.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3020  ecotin  27.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1123  ecotin  27.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5713  ecotin  25.86 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0907  ecotin  28.7 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0977  ecotin  27.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.473184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3044  ecotin  27.78 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1549  ecotin  27.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1117  ecotin  27.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2296  ecotin  24.07 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2432  ecotin  24.07 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2392  ecotin  25.77 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1775  ecotin  25.77 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2387  ecotin  25.77 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06891  hypothetical protein  28.97 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1296  proteinase inhibitor I11, ecotin  25.83 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000482651  hitchhiker  0.00123661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0903  ecotin  22.22 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.092793  normal  0.0217852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>