250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0206 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0025  ISL3 family transposase  100 
 
 
194 aa  256  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0206  ISL3 family transposase  100 
 
 
125 aa  255  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1165  transposase  79.2 
 
 
406 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3683  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.17 
 
 
407 aa  119  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188081  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.17 
 
 
407 aa  119  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.817062  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.6 
 
 
407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  41.74 
 
 
411 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  41.74 
 
 
406 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32 
 
 
407 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32 
 
 
407 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32 
 
 
407 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32 
 
 
407 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5539  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.8 
 
 
407 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.704796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.64 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.27 
 
 
406 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.64 
 
 
417 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.2 
 
 
411 aa  57  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.2 
 
 
411 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.2 
 
 
411 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14350  transposase  29.41 
 
 
350 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.11 
 
 
421 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00450  transposase  29.41 
 
 
420 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04880  transposase  29.41 
 
 
420 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04670  transposase  29.41 
 
 
420 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10230  transposase  29.41 
 
 
420 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03140  transposase  29.41 
 
 
420 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14300  transposase  29.41 
 
 
420 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1951  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.16 
 
 
401 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.927726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3755  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.16 
 
 
401 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.34 
 
 
413 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.34 
 
 
413 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.91 
 
 
408 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3476  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.61 
 
 
431 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418883  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1834  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.61 
 
 
432 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2896  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.61 
 
 
390 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1271  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.61 
 
 
390 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.61 
 
 
389 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0315  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.44 
 
 
432 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677908  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.35 
 
 
407 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.37 
 
 
391 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.61 
 
 
390 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.37 
 
 
391 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.37 
 
 
391 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
396 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
396 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
396 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
396 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
396 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0010  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.4 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.4 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.4 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
396 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4095  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
433 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131916  normal  0.0139853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11340  transposase  32.08 
 
 
444 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0604712  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13832  transposase  32.08 
 
 
444 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0610041  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  32.91 
 
 
411 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  32.91 
 
 
411 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  32.91 
 
 
411 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1436  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
433 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172417  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5327  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
433 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5385  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
433 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.47 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2445  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.08593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0649  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0565  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3286  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0608  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1314  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  31.65 
 
 
411 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  31.65 
 
 
411 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.21 
 
 
395 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.21 
 
 
395 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  37.29 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  37.29 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  37.29 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  37.29 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2166  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000653372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2284  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0613621  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2376  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000671414  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2515  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.957885  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2840  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000161763  hitchhiker  3.30659e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3102  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3396  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.838186  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3527  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  30.43 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.21 
 
 
395 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.21 
 
 
395 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.21 
 
 
395 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.21 
 
 
395 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
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