More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3396 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0323  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  99.51 
 
 
407 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00100796  hitchhiker  0.000174276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0443  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0800  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1185  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
364 aa  752    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1310  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  99.51 
 
 
407 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0706375  normal  0.603162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1977  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00749361  hitchhiker  0.0098642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2166  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000653372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2284  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0613621  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2376  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000671414  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2515  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  99.51 
 
 
407 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.957885  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2840  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000161763  hitchhiker  3.30659e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3102  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3396  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  100 
 
 
407 aa  838    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.838186  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3527  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  99.51 
 
 
407 aa  835    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  71.67 
 
 
407 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5991  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  59.9 
 
 
401 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6415  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  59.9 
 
 
401 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2573  ISRSO15-transposase protein  55.42 
 
 
406 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1547  ISRSO15-transposase protein  55.42 
 
 
406 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.355973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1863  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1934  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2090  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1213  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0156  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2619  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604405  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0456  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0767  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1099  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0991  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1119  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0382  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1101  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0180  ISBma1, transposase  54.75 
 
 
406 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.017513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2011  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1016  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1512  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2438  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3241  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1917  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00988303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2265  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1439  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1019  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3299  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2202  isrso15-transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0150  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.116574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1283  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  54.16 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3176  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3471  ISBma1, transposase  54.5 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77379  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6812  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  54.16 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0465  ISBma1, transposase  54.25 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  55.47 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1656  ISBma1, transposase  57.14 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0734  ISBma1, transposase  57.14 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0916  ISBma1, transposase  55.21 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2078  ISBma1, transposase  55.21 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.64027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3118  ISBma1, transposase  55.21 
 
 
386 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000303493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3162  ISBma1, transposase  55.21 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  55.35 
 
 
386 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  55 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  55 
 
 
386 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0338  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  54.41 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.913809  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1291  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  54.41 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0083  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  54.41 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3755  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.24 
 
 
401 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1951  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.24 
 
 
401 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.927726  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06565  hypothetical protein  47.15 
 
 
397 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3524  ISBma1, transposase  51.9 
 
 
373 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  52.3 
 
 
353 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2583  ISBma1, transposase  59.66 
 
 
234 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.116044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1460  ISBma1, transposase  62.69 
 
 
191 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1230  ISBma1, transposase, interruption-N  51.42 
 
 
255 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1535  ISBma1, transposase  54.67 
 
 
241 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0613  ISBma1, transposase  49.58 
 
 
246 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2448  transposase  49.58 
 
 
246 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.04 
 
 
408 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.04 
 
 
408 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>