57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2256 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  64.71 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  62.86 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  46.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  54.84 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  45.68 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  48.68 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  47.22 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  48.61 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  53.23 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  47.83 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  54.1 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  51.61 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  44.44 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  40.91 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1463  hypothetical protein  40.24 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  49.28 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  36 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  45.16 
 
 
68 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2135  hypothetical protein  45.21 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  42.65 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0810  hypothetical protein  45.21 
 
 
73 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  46.88 
 
 
83 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0719  hypothetical protein  43.06 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  49.18 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  35.14 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  42.19 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2050  hypothetical protein  39.71 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.387597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  39.47 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  43.48 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  42.37 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  40.68 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  37.68 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_004310  BR1198  hypothetical protein  39.71 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1160  hypothetical protein  39.71 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1906  hypothetical protein  42.19 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  38.24 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  37.1 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2805  hypothetical protein  42.62 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  37.7 
 
 
97 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  44.07 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  38.24 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  32.93 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  29.85 
 
 
213 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  44.07 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  35.59 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>