85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1704 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  68.6 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  56.73 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  55.56 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  57.32 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  48.31 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  50.54 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2069  hypothetical protein  52.44 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4905  hypothetical protein  52.27 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0297  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56360  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  45.26 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2767  hypothetical protein  47.56 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  51.25 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0415  hypothetical protein  48.78 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3273  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  40.95 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  43.02 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2945  hypothetical protein  47.73 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0846796  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2897  hypothetical protein  50.63 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2814  hypothetical protein  50.63 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2994  hypothetical protein  50.63 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  46.88 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2533  arylsulfate sulfotransferase  43.14 
 
 		 115 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.499235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2119  hypothetical protein  43.14 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  44.71 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  47.62 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4481  hypothetical protein  49.4 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2721  hypothetical protein  46.88 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1379  hypothetical protein  49.37 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1144  hypothetical protein  46.43 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1192  hypothetical protein  46.34 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3281  hypothetical protein  46.43 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.733437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  44.71 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3933  hypothetical protein  46.43 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  40.57 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  46.34 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1198  hypothetical protein  45.12 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  45.12 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1160  hypothetical protein  45.12 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  45.12 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3865  hypothetical protein  41.3 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  42.39 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  43.9 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  46.81 
 
 		 213 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0957  arylsulfate sulfotransferase-like protein  41.25 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4413  hypothetical protein  31.58 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4207  hypothetical protein  35.62 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1240  hypothetical protein  37.88 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1211  hypothetical protein  37.88 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  37.18 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  33.33 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  32.05 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  31.71 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1405  hypothetical protein  31.51 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  41.1 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3982  hypothetical protein  31.51 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3133  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000719039  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  36.23 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  42.31 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5221  hypothetical protein  30.88 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  39.44 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  34.29 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  42.42 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  43.66 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  34.29 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  33.85 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  39.13 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  38.81 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  34.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  36.92 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  51.35 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  36.51 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  32.93 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>