54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4600 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  63.16 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  62.86 
 
 		 82 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  52.94 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  48.72 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  49.28 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  50.72 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  50.75 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  48.48 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1463  hypothetical protein  44.87 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  49.21 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2135  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  41.18 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0810  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  52.46 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  45.68 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2050  hypothetical protein  43.08 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.387597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  44.62 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  49.21 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  47.37 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  43.75 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  42.67 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  42.19 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  38.75 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  39.24 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0719  hypothetical protein  43.94 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  46.97 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  40.74 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  41.77 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  40.58 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  40.58 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  35.48 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  45.33 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  37.84 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  34.85 
 
 		 213 aa  47.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  39.44 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  34.72 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  42.25 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2805  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  32.26 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1144  hypothetical protein  39.44 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  35.06 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  39.06 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1906  hypothetical protein  39.68 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2533  arylsulfate sulfotransferase  40 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.499235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2119  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  45 
 
 		 117 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>