49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2028 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  92.55 
 
 		 91 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  80.85 
 
 		 87 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  87.65 
 
 		 84 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  82.98 
 
 		 92 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  75.53 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  86.42 
 
 		 84 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  70.51 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  61.76 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  61.76 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  51.39 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  47.14 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  53.12 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  53.12 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  52.31 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  44.74 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  44.29 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  48.53 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  51.67 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2805  hypothetical protein  43.84 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  43.24 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  43.24 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  44.62 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0719  hypothetical protein  45.45 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2050  hypothetical protein  40.91 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.387597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  41.33 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  42.65 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  44.93 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1906  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2135  hypothetical protein  43.08 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0810  hypothetical protein  43.08 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  39.44 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  43.08 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  29.79 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  43.33 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  39.39 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  40.58 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  35.06 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1463  hypothetical protein  38.98 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  34.29 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  29.21 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  30.43 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>