82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3367 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  67.06 
 
 		 98 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  65.88 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  48.31 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  45.78 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  48.86 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1192  hypothetical protein  47.67 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1379  hypothetical protein  47.67 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2814  hypothetical protein  46.51 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2897  hypothetical protein  46.51 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2994  hypothetical protein  46.51 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2069  hypothetical protein  42.7 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  43.75 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  36.59 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2767  hypothetical protein  43.37 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0297  hypothetical protein  44.05 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0415  hypothetical protein  42.17 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0270  hypothetical protein  43.37 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4905  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  34.88 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  40.96 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1198  hypothetical protein  40.96 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56360  hypothetical protein  38.82 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1160  hypothetical protein  40.96 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3281  hypothetical protein  39.76 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.733437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  38.82 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  38.37 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  40.96 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3273  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3933  hypothetical protein  37.35 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3865  hypothetical protein  38.55 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  38.37 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  36.14 
 
 		 123 aa  66.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  36.9 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  38.55 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2945  hypothetical protein  36.47 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0846796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1144  hypothetical protein  34.15 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2721  hypothetical protein  39.77 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  41.57 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2533  arylsulfate sulfotransferase  37.21 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.499235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2119  hypothetical protein  37.21 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4481  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4004  hypothetical protein  35.53 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0957  arylsulfate sulfotransferase-like protein  33.72 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  38.03 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1240  hypothetical protein  34.21 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4413  hypothetical protein  30.67 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1405  hypothetical protein  35.82 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3982  hypothetical protein  35.82 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0137896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  36.76 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  36.23 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  32.86 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  37.14 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5221  hypothetical protein  34.85 
 
 		 109 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  31.51 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000719039  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  37.88 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  37.31 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  31.88 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  30.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  29.09 
 
 		 85 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  31.88 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  32.26 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  47.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  36.07 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  31.88 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  35.38 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  31.88 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  29.73 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  30.43 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  32.39 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  33.8 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>