54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2788 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  201  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  86.41 
 
 
103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  77.78 
 
 
74 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  65.82 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  68.49 
 
 
82 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  60.56 
 
 
86 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  59.09 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  52.86 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  59.38 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  53.85 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  60.29 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  52.24 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  54.69 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  50.72 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  53.12 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  53.12 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  61.54 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2050  hypothetical protein  53.97 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.387597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  65 
 
 
83 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  52.86 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  56.25 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2135  hypothetical protein  54.69 
 
 
73 aa  66.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  57.38 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0810  hypothetical protein  54.69 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1463  hypothetical protein  50.72 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1906  hypothetical protein  56.45 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  53.33 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0719  hypothetical protein  50.77 
 
 
72 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  46.38 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2805  hypothetical protein  49.23 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  47.76 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  43.66 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  44.78 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  47.3 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  47.3 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  47.37 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  40.85 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  47.69 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  33.85 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  45.83 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  43.94 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  35.58 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  42.42 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  43.75 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  38.81 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  38.33 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0415  hypothetical protein  40.3 
 
 
134 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  35.9 
 
 
124 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  39.39 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  33.8 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>