70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3509 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  93.97 
 
 
116 aa  229  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1144  hypothetical protein  64.91 
 
 
120 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_004310  BR1198  hypothetical protein  63.48 
 
 
136 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1160  hypothetical protein  63.48 
 
 
136 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  62.61 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  55.36 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3865  hypothetical protein  53.04 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  56.76 
 
 
127 aa  121  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  54.95 
 
 
142 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2767  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  51.75 
 
 
128 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0415  hypothetical protein  51.38 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0297  hypothetical protein  52.78 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  51.79 
 
 
123 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3281  hypothetical protein  50.98 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.733437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0270  hypothetical protein  51.85 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3933  hypothetical protein  48.04 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252755  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2945  hypothetical protein  53.26 
 
 
110 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0846796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3273  hypothetical protein  51.04 
 
 
100 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56360  hypothetical protein  55.42 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  47.12 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4905  hypothetical protein  55.42 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  50.53 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4481  hypothetical protein  47.12 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2721  hypothetical protein  51.72 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2533  arylsulfate sulfotransferase  51.81 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.499235  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2119  hypothetical protein  51.81 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  40.57 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2994  hypothetical protein  44.05 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1379  hypothetical protein  44.05 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2897  hypothetical protein  44.05 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2814  hypothetical protein  44.05 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  42.68 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  41.46 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  45.12 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1192  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0957  arylsulfate sulfotransferase-like protein  42.17 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  41.46 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  40.45 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  40.51 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2069  hypothetical protein  40.48 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196249  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  37.08 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  37.35 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  36.9 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  42.68 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  37.35 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  37.04 
 
 
213 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5221  hypothetical protein  35.56 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3133  hypothetical protein  34.18 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000719039  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  38.36 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  42.42 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  43.55 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1405  hypothetical protein  29.11 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278829  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  39.71 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  46.03 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4207  hypothetical protein  28.17 
 
 
109 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618689  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  29.27 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3982  hypothetical protein  29.11 
 
 
85 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0137896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1240  hypothetical protein  28.17 
 
 
109 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253936  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1211  hypothetical protein  28.17 
 
 
112 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  38.24 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4004  hypothetical protein  28.17 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4413  hypothetical protein  30.99 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670667  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  30.77 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  34.38 
 
 
1140 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  34.38 
 
 
1131 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>