66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3211 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  63.16 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  64.71 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  54.17 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  52.24 
 
 
76 aa  66.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  50 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  47.69 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  46.88 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  44.78 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2050  hypothetical protein  42.31 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.387597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  46.58 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  46.48 
 
 
88 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  45.95 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  46.97 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  43.66 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  49.18 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  39.39 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0719  hypothetical protein  46.15 
 
 
72 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  39.39 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  39.39 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2135  hypothetical protein  43.08 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  37.97 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0810  hypothetical protein  43.08 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  46.88 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1906  hypothetical protein  44.93 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  40.85 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  43.08 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  39.39 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  39.39 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1463  hypothetical protein  45.9 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  41.27 
 
 
80 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  45.45 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  44 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  43.33 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  42.31 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  38.55 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  36.92 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  36.99 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  43.18 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2805  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  46.51 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3865  hypothetical protein  44.23 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3281  hypothetical protein  43.48 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.733437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  39.13 
 
 
213 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2721  hypothetical protein  32.56 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56360  hypothetical protein  38.46 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  29.09 
 
 
89 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4905  hypothetical protein  38.46 
 
 
102 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  32.94 
 
 
116 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3273  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0957  arylsulfate sulfotransferase-like protein  42.31 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3933  hypothetical protein  43.48 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252755  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  42.5 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343118 
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  37.68 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0297  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  31.88 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  32.81 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>