67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0309 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  80.99 
 
 		 127 aa  213  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0270  hypothetical protein  68.94 
 
 		 134 aa  183  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0415  hypothetical protein  68.18 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0297  hypothetical protein  68.94 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2767  hypothetical protein  61.26 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3865  hypothetical protein  65.18 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3281  hypothetical protein  59.05 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.733437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3933  hypothetical protein  56.19 
 
 		 125 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  53.39 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  54.95 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  46.97 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1160  hypothetical protein  50.45 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1198  hypothetical protein  50.45 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2721  hypothetical protein  51.49 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  50.45 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3273  hypothetical protein  51.46 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  50.5 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2945  hypothetical protein  50.51 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0846796  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4481  hypothetical protein  54.65 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56360  hypothetical protein  51.16 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  52.33 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1144  hypothetical protein  47.75 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4905  hypothetical protein  51.16 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  45.61 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  49.47 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0957  arylsulfate sulfotransferase-like protein  50 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2119  hypothetical protein  51.16 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2533  arylsulfate sulfotransferase  51.16 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.499235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  52.94 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  44.68 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1379  hypothetical protein  41.94 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2897  hypothetical protein  41.94 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  41.84 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2814  hypothetical protein  41.94 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2994  hypothetical protein  41.94 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  44.71 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  44.71 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1192  hypothetical protein  40.86 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  42.39 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2069  hypothetical protein  43.02 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  43.02 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  39.08 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  35.63 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  37.33 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5221  hypothetical protein  32.22 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3133  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000719039  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3982  hypothetical protein  36.49 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1405  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1240  hypothetical protein  34.94 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1211  hypothetical protein  34.94 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4004  hypothetical protein  33.73 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4207  hypothetical protein  33.73 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4413  hypothetical protein  35.53 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  43.18 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  33.75 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  32.47 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  36.62 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  35.06 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  37.1 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  28.99 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>