63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4707 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2069  hypothetical protein  65.91 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  51.06 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  49.38 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  49.38 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  50.56 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  49.44 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  48.19 
 
 		 97 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  40.91 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56360  hypothetical protein  42.72 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4905  hypothetical protein  41.41 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2721  hypothetical protein  46.88 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1645  siderophore biosynthesis protein-like protein  46.15 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.354756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2767  hypothetical protein  47.5 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3273  hypothetical protein  41.35 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  45.16 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  42.39 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2533  arylsulfate sulfotransferase  44.79 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.499235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2119  hypothetical protein  44.79 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2945  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0846796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0297  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4481  hypothetical protein  48.15 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0270  hypothetical protein  38.68 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2704  hypothetical protein  47.06 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0415  hypothetical protein  38.68 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  42.39 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2994  hypothetical protein  42.17 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2897  hypothetical protein  42.17 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1379  hypothetical protein  42.17 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2814  hypothetical protein  42.17 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  41.3 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  42.5 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1192  hypothetical protein  42.17 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3865  hypothetical protein  46.84 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3391  hypothetical protein  43.02 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0957  arylsulfate sulfotransferase-like protein  39.76 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3281  hypothetical protein  41.57 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.733437  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1144  hypothetical protein  40.51 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  42.7 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  38.2 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  37.08 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3933  hypothetical protein  40.45 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  38.2 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  41.1 
 
 		 213 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1160  hypothetical protein  40.51 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1198  hypothetical protein  40.51 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1211  hypothetical protein  43.66 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4207  hypothetical protein  43.66 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1240  hypothetical protein  43.66 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4004  hypothetical protein  40.79 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2334  hypothetical protein  36.71 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1405  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3982  hypothetical protein  38.57 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4413  hypothetical protein  36.71 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3133  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000719039  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5221  hypothetical protein  35.21 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  35.82 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  29.27 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  32.05 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  35.82 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>