More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0342 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0342  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  100 
 
 		 355 aa  712    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1639  ABC transporter, ATP-binding protein  69.52 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0428  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  59.5 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.982336  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1720  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  58.07 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0365  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0192  ABC transporter related  51.59 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  48.27 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0274  ABC transporter related  52.16 
 
 		 342 aa  342  5e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0845  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  49.71 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1056  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  49.39 
 
 		 350 aa  327  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  44.16 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  46.2 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  44.41 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  44.41 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 		 346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  44.16 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  44.67 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  43.68 
 
 		 340 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 346 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  46.65 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  44.57 
 
 		 346 aa  301  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  45.22 
 
 		 338 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  42.49 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 339 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  44.51 
 
 		 339 aa  298  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.38 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  44.26 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  44.05 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 343 aa  292  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  42.36 
 
 		 354 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 		 345 aa  289  6e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.14 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  41.98 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  41.76 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 		 344 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  42.74 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  42.17 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  42.74 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  42.74 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  43.53 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  42.74 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 382 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>