More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2304 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
192 aa  393  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75 
 
 
192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.430626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2700  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75 
 
 
192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.07 
 
 
197 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.64 
 
 
196 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.12 
 
 
196 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.12 
 
 
196 aa  188  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.89 
 
 
195 aa  187  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.62 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.62 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.42 
 
 
195 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1130  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.47 
 
 
195 aa  185  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.92 
 
 
203 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1566  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
195 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
195 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.92 
 
 
203 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.66 
 
 
194 aa  184  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
195 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  184  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.6 
 
 
195 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1527  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1292  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.81 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.59 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.07 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.5 
 
 
197 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
197 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1331  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.81 
 
 
195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1080  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.54 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.306256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.94 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.81 
 
 
195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.07 
 
 
209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.15 
 
 
195 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
195 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1989  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.706467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
197 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
196 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
197 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
197 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.21 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.98 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1625  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
196 aa  178  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.03 
 
 
195 aa  178  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.98 
 
 
198 aa  178  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.98 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.98 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.21 
 
 
197 aa  177  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.62 
 
 
199 aa  176  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.07 
 
 
202 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4919  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.21 
 
 
197 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  hitchhiker  0.001484 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.83 
 
 
208 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.04 
 
 
201 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
197 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
197 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.46 
 
 
195 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.21 
 
 
197 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
194 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1476  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.97 
 
 
194 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.46 
 
 
206 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42.93 
 
 
195 aa  175  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.92 
 
 
206 aa  175  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.55 
 
 
202 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
195 aa  175  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42.93 
 
 
200 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0289  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.68 
 
 
210 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0309  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.68 
 
 
210 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7048  decreased coverage  0.00641142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.15 
 
 
197 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.97 
 
 
197 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.03 
 
 
195 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1569  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.81 
 
 
202 aa  174  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42.19 
 
 
201 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.52 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42.93 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.15 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.84 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.79 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.07 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>