20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0237 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0237    100 
 
 		 1085 bp  2151    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0087407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  91.67 
 
 		 1359 bp  79.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  83.33 
 
 		 1302 bp  67.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  87.69 
 
 		 1386 bp  65.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 1299 bp  58  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  88.68 
 
 		 1335 bp  58  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  92.5 
 
 		 1329 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  86.44 
 
 		 1320 bp  54  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  86.44 
 
 		 1239 bp  54  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  86.44 
 
 		 1302 bp  54  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  88 
 
 		 1296 bp  52  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  100 
 
 		 933 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  87.76 
 
 		 1326 bp  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  93.94 
 
 		 1341 bp  50.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  96.43 
 
 		 1392 bp  48.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  93.75 
 
 		 1305 bp  48.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  96.43 
 
 		 1446 bp  48.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2032  hypothetical protein  100 
 
 		 1494 bp  48.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0682699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  87.5 
 
 		 1284 bp  48.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1878  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 1140 bp  48.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>