26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2244 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2244  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0590  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0494  hypothetical protein  83.33 
 
 
96 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.341106  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  33.66 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  32.38 
 
 
187 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  32.38 
 
 
187 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  35.29 
 
 
188 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  32.67 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  32.38 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  31.07 
 
 
195 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  32.38 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  32.38 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  32.32 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  32.38 
 
 
187 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  32.38 
 
 
187 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  31.43 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  31.43 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  31.31 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  35.87 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  33.33 
 
 
189 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  36.47 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  33.73 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  31.43 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  30 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  27.45 
 
 
189 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  31.07 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>