21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0494 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.341106  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0590  hypothetical protein  85.42 
 
 		 96 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2244  hypothetical protein  83.33 
 
 		 96 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  31 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  30.69 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  30.48 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  31.07 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  30.48 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  30.48 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  30.48 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  30.48 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  30.48 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  33.33 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  30.48 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  29.52 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  29.52 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  29.7 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  30.39 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  31.18 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>