21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1337 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  100 
 
 		 171 aa  350  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  85.39 
 
 		 178 aa  299  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  66.67 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  37.31 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  34.33 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  30.29 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0793  hypothetical protein  27.4 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00522604  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2800  hypothetical protein  28.98 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  26.9 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3392  hypothetical protein  37.89 
 
 		 445 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341472  normal  0.0243154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3188  hypothetical protein  28.74 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.729943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2810  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.896787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4083  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4195  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  25.34 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  25.34 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3840  hypothetical protein  31.94 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1958  hypothetical protein  32.38 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0423  hypothetical protein  22.91 
 
 		 245 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>