22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1455 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  66.85 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  67.39 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  40.72 
 
 		 227 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  39.11 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  29.86 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3188  hypothetical protein  29.34 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.729943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2800  hypothetical protein  35.87 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0793  hypothetical protein  31.93 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00522604  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  36.05 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  27.61 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4195  hypothetical protein  36.51 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4083  hypothetical protein  36.51 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3392  hypothetical protein  37.29 
 
 		 445 aa  47.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341472  normal  0.0243154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2810  hypothetical protein  32.89 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.896787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3840  hypothetical protein  38.98 
 
 		 200 aa  44.3  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3573  putative proline-rich protein  26.88 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  26.45 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  25.69 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3298  hypothetical protein  39.68 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0423  hypothetical protein  26.96 
 
 		 245 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0707  hypothetical protein  35.82 
 
 		 326 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0284304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>