19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2053 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  299  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  64.29 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  63.64 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1385  hypothetical protein  55.15 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.940229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  48.43 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  45.29 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  46.11 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1817  hypothetical protein  48.28 
 
 		 172 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  29.45 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  28.3 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  26.62 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  24.04 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3392  hypothetical protein  36.67 
 
 		 445 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341472  normal  0.0243154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3840  hypothetical protein  34.94 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2605  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  24.54 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0707  hypothetical protein  48.72 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0284304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0698  hypothetical protein  46.15 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0654  putative protein with proline-alanine-aspartic repeated motif  46.15 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.791492  normal  0.041416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>