20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1817 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  333  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  51.16 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  47.7 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  49.43 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1385  hypothetical protein  46.24 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.940229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  45.4 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  43.21 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  27.91 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  27.61 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  28.12 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3392  hypothetical protein  40.59 
 
 		 445 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341472  normal  0.0243154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  27.5 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3840  hypothetical protein  45 
 
 		 200 aa  47.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4143  hypothetical protein  34.88 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.0338226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2605  hypothetical protein  37.08 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  35.05 
 
 		 175 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3304  hypothetical protein  27.39 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2800  hypothetical protein  35.48 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0601446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>