16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1576 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  47.09 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  38.64 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  36.36 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  37.27 
 
 		 178 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0793  hypothetical protein  28.72 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00522604  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0423  hypothetical protein  26.89 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3392  hypothetical protein  40 
 
 		 445 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341472  normal  0.0243154 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4083  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4195  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2800  hypothetical protein  34.83 
 
 		 176 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3840  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4143  hypothetical protein  36.47 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.0338226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  38.3 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0596  hypothetical protein  39.33 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0310086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>