16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4195 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4083  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4195  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2682  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  32.61 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2605  hypothetical protein  39.31 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  37.1 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  33.96 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5202  hypothetical protein  26.98 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0423  hypothetical protein  26.55 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  27.93 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2800  hypothetical protein  29.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3298  hypothetical protein  29.38 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3737  hypothetical protein  30.66 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  28.87 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>