20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1402 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  87.64 
 
 		 171 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  66.49 
 
 		 184 aa  241  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  39.13 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2800  hypothetical protein  30.05 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2393  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0793  hypothetical protein  27.74 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00522604  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  25.64 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  28.87 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3392  hypothetical protein  38.98 
 
 		 445 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341472  normal  0.0243154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2810  hypothetical protein  26.5 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.896787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4195  hypothetical protein  34.92 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4083  hypothetical protein  34.92 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3188  hypothetical protein  28.85 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.729943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0596  hypothetical protein  31.34 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0310086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2605  hypothetical protein  25.9 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3840  hypothetical protein  37.29 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1958  hypothetical protein  32.04 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>