15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0486 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  334  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  65.29 
 
 
159 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1385  hypothetical protein  43.75 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.940229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  46.71 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  48.19 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  48.19 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  38.42 
 
 
174 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1817  hypothetical protein  43.1 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  31.03 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  27.54 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  28.17 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  27.59 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0596  hypothetical protein  51.22 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0310086  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2605  hypothetical protein  30.53 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0793  hypothetical protein  24.52 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00522604  normal  0.142472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>