129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5124 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  76.85 
 
 
108 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  58.72 
 
 
121 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  59.22 
 
 
103 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  50.45 
 
 
115 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  52.29 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  53.21 
 
 
115 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  48.65 
 
 
116 aa  95.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  47.71 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  39.64 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.73 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.95 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.95 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  40.54 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  40.54 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  40.54 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  40.54 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.72 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.51 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.05 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.42 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.39 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  40.38 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.51 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.64 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.66 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.02 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.64 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  36.54 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.96 
 
 
106 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  37.04 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.45 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.91 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.58 
 
 
109 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  33.65 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.19 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  33.98 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  33.65 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  33.65 
 
 
111 aa  57.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.95 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.31 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.65 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.81 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.33 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  34.18 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.65 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.29 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.75 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.62 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.63 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.63 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  35.51 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.82 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.78 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  34.18 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.58 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.37 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.52 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.11 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.37 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.98 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.19 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.65 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.56 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.22 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  32.69 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.9 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.37 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.91 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.37 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  32.93 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  39.13 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.71 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.75 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  44.44 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.02 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  34.92 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.03 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.82 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.17 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1424  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.94 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905577  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2049  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.4 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.93 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.43 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>