51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3768 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  98.08 
 
 		 116 aa  204  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  98.08 
 
 		 116 aa  204  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  98.08 
 
 		 116 aa  204  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  97.12 
 
 		 116 aa  201  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  58.82 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  59.8 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  48.04 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  51.96 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  51 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  47.12 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.19 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  42.31 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.42 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.31 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.23 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.19 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.78 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.85 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.19 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  32.71 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.37 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.65 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.67 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.67 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  37 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.27 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.48 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.68 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  39.47 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.29 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  40.22 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  39.56 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  39.56 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  36.56 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.37 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.21 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  31.37 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2049  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.23 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.69 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.65 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.18 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>