76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2866 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
120 aa  242  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  51.35 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  50 
 
 
116 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  43.24 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  47.22 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  47.22 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  44.25 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  45.05 
 
 
116 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  45.05 
 
 
116 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  45.05 
 
 
116 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  45.05 
 
 
116 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  44.66 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.73 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.19 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.75 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.81 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.61 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.61 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  32.14 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  35.85 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.13 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.26 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.45 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.84 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.78 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.46 
 
 
109 aa  53.9  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.19 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.64 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.38 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
109 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.1 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.91 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.41 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.97 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.78 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.09 
 
 
121 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.3 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.94 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.73 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.71 
 
 
109 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  28.71 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  29.63 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  29.13 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  28.3 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.51 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.73 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  36.11 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.76 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  29.73 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.1 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.91 
 
 
116 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.11 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.14 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.24 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  26.8 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.73 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.53 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  28.83 
 
 
117 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.36 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.43 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.19 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  31.43 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  31.43 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.91 
 
 
116 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.91 
 
 
116 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>