89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1099 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  100 
 
 		 113 aa  234  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  62.26 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  64.49 
 
 		 110 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  55.86 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.01 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.94 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  49.07 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  53.15 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  53.15 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  53.15 
 
 		 111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  53.15 
 
 		 111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  53.15 
 
 		 111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.15 
 
 		 111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  52.25 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.46 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  53.92 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.95 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.75 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.27 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.58 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.53 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.9 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.59 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.59 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.57 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.05 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.51 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  61.7 
 
 		 48 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.19 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  33 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.54 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.54 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.44 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  36.49 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  36.19 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  42.17 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  36.7 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  40 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  40 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  40 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.33 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  31.48 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  39.76 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.8 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  34.07 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.29 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  41.82 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.58 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  33.03 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.47 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  33.02 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  29.21 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.24 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.56 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.42 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  33.64 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.79 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.53 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.58 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.59 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  27.27 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  29.35 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.79 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  27.66 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6236  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.11 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.289172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21830  growth inhibitor  34.34 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000451152  normal  0.350233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.43 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.51 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  34.04 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  27.45 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.71 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.66 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.58 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.94 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.72 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  19.23 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.73 
 
 		 133 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.67 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.27 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.66 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  25.3 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 		 147 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>