66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0352 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.45 
 
 
109 aa  97.1  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.94 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.94 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  43.88 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.92 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.94 
 
 
106 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.94 
 
 
106 aa  90.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.94 
 
 
107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.83 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.75 
 
 
107 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.94 
 
 
107 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.83 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  41.03 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.78 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0732  CopG family transcriptional regulator  39.24 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000257489  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.61 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.61 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  36.63 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.08 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6236  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.8 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.289172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  32.35 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.05 
 
 
102 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.09 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  34.31 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  32.35 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.35 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  34.31 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2435  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.18 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250291  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  32.35 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.35 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.62 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.68 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.95 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  32.65 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  32.65 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  32.65 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.65 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.85 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  32.65 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  32.65 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  32.65 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  32.65 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.34 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  28.16 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  32.65 
 
 
111 aa  42  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  28.16 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  28.16 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.23 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.65 
 
 
117 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  28.16 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  28.57 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2528  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.62 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.71 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.27 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.32 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.04 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.48 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.18 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.71 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  33.01 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.26 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.55 
 
 
116 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>