47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3307 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 48 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  83.33 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  79.17 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  70.21 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  66.67 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  69.57 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  69.57 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  61.7 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  60.87 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  60.87 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  63.04 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  61.36 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.45 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.52 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.45 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  55.32 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  58.54 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.78 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.17 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.11 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.11 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.83 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.78 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.44 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.48 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.19 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  48.78 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  42.86 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  50 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  39.58 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  50 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  50 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  50 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  52.27 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  52.27 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  47.73 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  51.52 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  37.21 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  50 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  47.62 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>