36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0785 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 123 aa  243  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  44.07 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  40.71 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  39.82 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  40.62 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  38.39 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.84 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  39.29 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  42.17 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  37.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  37.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  37.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  37.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.51 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.26 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.83 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.19 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  34.52 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.98 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.17 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.17 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2505  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.44 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.51 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.34 
 
 		 130 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  29.21 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.18 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.19 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.14 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.7 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>