115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5455 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.26 
 
 
106 aa  141  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  58.49 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.77 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.89 
 
 
109 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.21 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.89 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  56.18 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.29 
 
 
109 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.57 
 
 
107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.67 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.57 
 
 
106 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  53.41 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.74 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.57 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.62 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.75 
 
 
97 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  41.76 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  39.62 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.2 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.23 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.98 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.98 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  34.82 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.93 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.86 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.36 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.94 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  33.94 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.79 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  33.33 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  34.23 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  31.43 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.93 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.38 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.14 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  31.43 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.17 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.13 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.14 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.19 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.41 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.32 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.23 
 
 
112 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1424  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.64 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905577  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.93 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.68 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.79 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.41 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  31.63 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.32 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.29 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.29 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  40.28 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  32.32 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2435  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
113 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0732  CopG family transcriptional regulator  38.71 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000257489  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.74 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.69 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  35.71 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  34.86 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  35.71 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  35.71 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.78 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  35.71 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  35.71 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.82 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  35.71 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.93 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>