49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2583 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 134 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  78.91 
 
 		 133 aa  220  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  69.17 
 
 		 127 aa  186  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2505  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  69 
 
 		 102 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  38.2 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.16 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.67 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  35.96 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  39.33 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.61 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  31.87 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.83 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  27.73 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.48 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.02 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  30.77 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.14 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.37 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  31.58 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.26 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  32.56 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  30.95 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.48 
 
 		 48 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.79 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.71 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  32.58 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.47 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.73 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  27.64 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.78 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.75 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  39.53 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  26.85 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.79 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  31.48 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  31.03 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.67 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>