104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0962 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
170 aa  346  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  77.78 
 
 
111 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  70 
 
 
112 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  69.32 
 
 
114 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  67.05 
 
 
112 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.13 
 
 
72 aa  97.4  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.67 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.51 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.84 
 
 
116 aa  79  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.83 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  48.81 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  48.81 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.51 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.68 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  45.24 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  45.24 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  45.24 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.05 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.38 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.58 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.67 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.07 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  44.19 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.19 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  44.19 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.02 
 
 
115 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.02 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.24 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  40.48 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  36.04 
 
 
121 aa  61.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 
112 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
118 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1424  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.88 
 
 
88 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905577  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.23 
 
 
119 aa  55.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.82 
 
 
114 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  34.15 
 
 
113 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  36.84 
 
 
108 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  34.86 
 
 
110 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  28.42 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.42 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  28.42 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  28.42 
 
 
111 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  28.42 
 
 
103 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  28.42 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  36.36 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  28.42 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  28.42 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.94 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.07 
 
 
111 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.87 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.48 
 
 
110 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.51 
 
 
114 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  35.71 
 
 
114 aa  47.8  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.51 
 
 
114 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.27 
 
 
116 aa  47.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.77 
 
 
109 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.71 
 
 
115 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  31.58 
 
 
113 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.8 
 
 
118 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.35 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  34.18 
 
 
106 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  38.82 
 
 
115 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2003  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.65 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  33.33 
 
 
110 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  29.76 
 
 
124 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12023  hypothetical protein  36.56 
 
 
114 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.71 
 
 
102 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.38 
 
 
117 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.66 
 
 
109 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
120 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.82 
 
 
111 aa  44.3  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
115 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647439  decreased coverage  0.00158876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0572  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.72 
 
 
107 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.14 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.37 
 
 
124 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.52 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  37.5 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
109 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  33.71 
 
 
118 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  36.36 
 
 
115 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.44 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.75 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 
118 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.3 
 
 
119 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36 
 
 
117 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>