14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4469 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4469  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  820    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3838  hypothetical protein  63.03 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.44323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1650  hypothetical protein  61.74 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  29.57 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  28.86 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44730  O-antigen polymerase protein  26.4 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  23.9 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 620 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4986  hypothetical protein  31.43 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0534  hypothetical protein  31.43 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>